Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
HDAC1Q13547 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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