Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MKRN3Q13064 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL355338.1-201ENST00000612598 913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MKRN3Q13064 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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