Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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FOXF1Q12946 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXF1Q12946 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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