Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NIPAL4Q0D2K0 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NIPAL4Q0D2K0 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms