Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SSRP1Q08945 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms