Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALD1Q05682 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms