Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
BNC1Q01954 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
BNC1Q01954 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms