Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
IRF9Q00978 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms