Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HSF1Q00613 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HSF1Q00613 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms