Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HERVK_113P63132 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms