Protein–RNA interactions for Protein: P62820

RAB1A, Ras-related protein Rab-1A, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB1AP62820 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAB1AP62820 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms