Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
ARF6P62330 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
ARF6P62330 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
ARF6P62330 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms