Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2NP61088 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms