Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CTBP2P56545 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms