Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
BRPF1P55201 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms