Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
DAP3P51398 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms