Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CLK1P49759 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLK1P49759 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLK1P49759 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLK1P49759 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CLK1P49759 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLK1P49759 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CLK1P49759 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CLK1P49759 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms