Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GNPDA1P46926 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GNPDA1P46926 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms