Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CHRNA3P32297 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms