Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GABRA5P31644 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms