Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
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CASQ1P31415 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CASQ1P31415 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CASQ1P31415 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CASQ1P31415 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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CASQ1P31415 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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CASQ1P31415 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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CASQ1P31415 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CASQ1P31415 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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