Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRKCHP24723 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRKCHP24723 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms