Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ITGAMP11215 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms