Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHGAP10645 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHGAP10645 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CHGAP10645 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHGAP10645 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHGAP10645 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHGAP10645 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CHGAP10645 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CHGAP10645 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CHGAP10645 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms