Protein–RNA interactions for Protein: O95076

ALX3, Homeobox protein aristaless-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX3O95076 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ALX3O95076 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ALX3O95076 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms