Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PRPF3O43395 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms