Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FANCAO15360 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FANCAO15360 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FANCAO15360 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FANCAO15360 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC26.01■■□□□ 1.76
FANCAO15360 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FANCAO15360 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
FANCAO15360 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FANCAO15360 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FANCAO15360 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FANCAO15360 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms