Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP9YO00507 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms