Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZNF879B4DU55 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ZNF879B4DU55 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms