Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
A3GALT2U3KPV4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms