Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
KLHDC2Q9Y2U9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms