Protein–RNA interactions for Protein: Q9XRX5

HHLA3, HERV-H LTR-associating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA3Q9XRX5 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
HHLA3Q9XRX5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms