Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
L1RE1Q9UN81 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
L1RE1Q9UN81 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms