Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE6

PALD1, Paladin, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALD1Q9ULE6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PALD1Q9ULE6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms