Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RNF7Q9UBF6 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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