Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KLHL9Q9P2J3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms