Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DNAJC28Q9NX36 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DNAJC28Q9NX36 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms