Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ASF1BQ9NVP2 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ASF1BQ9NVP2 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms