Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CNTNAP4Q9C0A0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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