Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVV2

FNDC11, Fibronectin type III domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC11Q9BVV2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FNDC11Q9BVV2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms