Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CFAP53Q96M91 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms