Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
C9orf72Q96LT7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms