Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSRNP3Q8WYN3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSRNP3Q8WYN3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms