Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCDC12Q8WUD4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC12Q8WUD4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms