Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPAS3Q8IXF0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPAS3Q8IXF0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms