Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
WDR53Q7Z5U6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms