Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DCAF4-203ENST00000394234 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
C16orf54Q6UWD8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms