Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FAM208BQ5VWN6 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms