Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT06

CEP350, Centrosome-associated protein 350, humanhuman

Predictions only

Length 3,117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP350Q5VT06 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CEP350Q5VT06 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CEP350Q5VT06 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms