Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CCDC92Q53HC0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC92Q53HC0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms